El sistema de tributación por módulos está restringido a determinados comercios minoristas y con determinadas limitaciones de facturación (250.000 euros para comercios minoristas, 125.000 euros para facturas a otros profesionales).

Básicamente, consiste en pagar en función de unos baremos fijos como la potencia eléctrica, el número de empleados o las dimensiones de un local.

Pagas una cantidad fija, tengas o no beneficios, pero está disociada de la facturación que tengas.

Tradicionalmente, el sistema de módulos ha sido muy atractivo para los autónomos porque, en caso de ganar más, no había un incremento en la carga fiscal; eso sí, en caso de pérdidas, también se tenía que abonar, pero sí había el elemento de previsibilidad.

Además, también es más simple, porque no exige toda la documentación que sí requiere la estimación directa.

Sin embargo, la Agencia Tributaria, en los últimos años, ha aplicado un criterio restrictivo para este modelo y cada vez son menos comercios, y en condiciones más limitadas, los que pueden acogerse a él. 

Existiría un supuesto en el que una tienda física podría realizar tributación con su eCommerce con módulos, pero siempre y cuando la venta física sea la actividad principal y las ventas online supongan un porcentaje reducido del total.

Por esa razón, y como principio general, no se debe aplicar este criterio. Este es un sistema que está llamado a desaparecer a largo plazo y que no se aplica en el ámbito 100 % online.